MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 plasmid pLR584

Total Repeats: 464

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015701	ATT	2	6	4	9	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015701	TAA	2	6	56	61	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015701	ACC	2	6	102	107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015701	CA	3	6	159	164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015701	A	6	6	170	175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015701	CG	3	6	194	199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015701	A	7	7	208	214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015701	TAA	2	6	246	251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015701	TAT	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015701	T	6	6	315	320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015701	TAT	2	6	331	336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015701	ACC	2	6	373	378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338204607
13	NC_015701	AGAA	2	8	392	399	75 %	0 %	25 %	0 %	338204607
14	NC_015701	CTA	2	6	437	442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204607
15	NC_015701	AAC	2	6	443	448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204607
16	NC_015701	TGA	2	6	492	497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204607
17	NC_015701	A	6	6	532	537	100 %	0 %	0 %	0 %	338204607
18	NC_015701	ATC	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204607
19	NC_015701	GAG	2	6	623	628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338204607
20	NC_015701	TTG	2	6	698	703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204607
21	NC_015701	AAC	2	6	721	726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204608
22	NC_015701	AAT	2	6	783	788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204608
23	NC_015701	ACTAT	2	10	808	817	40 %	40 %	0 %	20 %	338204608
24	NC_015701	GGCAA	2	10	828	837	40 %	0 %	40 %	20 %	338204608
25	NC_015701	GAAAT	2	10	874	883	60 %	20 %	20 %	0 %	338204608
26	NC_015701	ATG	3	9	889	897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204608
27	NC_015701	AGA	2	6	907	912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204608
28	NC_015701	AC	3	6	949	954	50 %	0 %	0 %	50 %	338204608
29	NC_015701	AC	3	6	1171	1176	50 %	0 %	0 %	50 %	338204608
30	NC_015701	TGA	2	6	1201	1206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204608
31	NC_015701	A	6	6	1331	1336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015701	ACAA	2	8	1380	1387	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015701	A	6	6	1392	1397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015701	A	6	6	1436	1441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015701	T	6	6	1457	1462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015701	CCAA	2	8	1515	1522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015701	ACA	2	6	1535	1540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015701	T	6	6	1542	1547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015701	TCA	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015701	CAA	2	6	1589	1594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015701	AAC	2	6	1661	1666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015701	TCA	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015701	GC	3	6	1741	1746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015701	CAC	2	6	1813	1818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015701	CGTA	2	8	1819	1826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015701	CGG	2	6	1839	1844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015701	ATTGA	2	10	1862	1871	40 %	40 %	20 %	0 %	338204609
48	NC_015701	GTT	2	6	1904	1909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204609
49	NC_015701	TTAG	2	8	1921	1928	25 %	50 %	25 %	0 %	338204609
50	NC_015701	TG	3	6	1949	1954	0 %	50 %	50 %	0 %	338204609
51	NC_015701	AGTT	2	8	2027	2034	25 %	50 %	25 %	0 %	338204609
52	NC_015701	CTT	2	6	2049	2054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338204609
53	NC_015701	AGTT	2	8	2121	2128	25 %	50 %	25 %	0 %	338204609
54	NC_015701	AGT	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204609
55	NC_015701	TTC	2	6	2175	2180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338204609
56	NC_015701	TAA	2	6	2220	2225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204609
57	NC_015701	CTTT	2	8	2234	2241	0 %	75 %	0 %	25 %	338204609
58	NC_015701	GTT	2	6	2246	2251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204609
59	NC_015701	ATC	2	6	2448	2453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204609
60	NC_015701	GTG	2	6	2469	2474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338204609
61	NC_015701	TAGA	2	8	2508	2515	50 %	25 %	25 %	0 %	338204609
62	NC_015701	CCT	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338204609
63	NC_015701	TCA	2	6	2638	2643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204609
64	NC_015701	AT	3	6	2644	2649	50 %	50 %	0 %	0 %	338204609
65	NC_015701	ATC	2	6	2665	2670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204609
66	NC_015701	CTA	2	6	2747	2752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204609
67	NC_015701	CGT	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204609
68	NC_015701	TAT	2	6	2801	2806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204609
69	NC_015701	TTG	2	6	2853	2858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204609
70	NC_015701	CCA	2	6	2870	2875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338204609
71	NC_015701	CCA	2	6	2902	2907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338204609
72	NC_015701	CTG	2	6	3038	3043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204609
73	NC_015701	TACCTT	2	12	3125	3136	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338204609
74	NC_015701	TAC	2	6	3149	3154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204609
75	NC_015701	TTG	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204609
76	NC_015701	ACT	2	6	3300	3305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015701	AGT	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015701	AGTT	2	8	3511	3518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015701	CTT	2	6	3534	3539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015701	CTTC	2	8	3568	3575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015701	ACT	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015701	AAAAAG	2	12	3682	3693	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015701	TAT	2	6	3700	3705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015701	CTTTT	2	10	3714	3723	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015701	TTA	2	6	3740	3745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015701	AAT	2	6	3747	3752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015701	AT	3	6	3751	3756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015701	T	6	6	3764	3769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015701	ATT	2	6	3778	3783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015701	TGGA	2	8	3859	3866	25 %	25 %	50 %	0 %	338204610
91	NC_015701	TTCTTT	2	12	3879	3890	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338204610
92	NC_015701	CAT	2	6	3929	3934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204610
93	NC_015701	ATC	2	6	3939	3944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204610
94	NC_015701	CAA	2	6	3948	3953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204610
95	NC_015701	T	8	8	4013	4020	0 %	100 %	0 %	0 %	338204610
96	NC_015701	AAAG	2	8	4052	4059	75 %	0 %	25 %	0 %	338204610
97	NC_015701	TCT	2	6	4069	4074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338204610
98	NC_015701	T	6	6	4106	4111	0 %	100 %	0 %	0 %	338204610
99	NC_015701	T	7	7	4143	4149	0 %	100 %	0 %	0 %	338204610
100	NC_015701	T	6	6	4170	4175	0 %	100 %	0 %	0 %	338204610
101	NC_015701	TCC	2	6	4191	4196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015701	T	7	7	4230	4236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015701	CTAC	2	8	4270	4277	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015701	T	6	6	4296	4301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015701	CAT	2	6	4302	4307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015701	TAA	2	6	4328	4333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015701	A	6	6	4363	4368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015701	ATT	3	9	4378	4386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015701	ATG	2	6	4389	4394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015701	AAACT	2	10	4438	4447	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015701	T	7	7	4450	4456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015701	CAT	2	6	4457	4462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015701	T	6	6	4501	4506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015701	TGC	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015701	A	7	7	4535	4541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015701	TAAAA	2	10	4624	4633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015701	TTAAAA	2	12	4658	4669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015701	CAC	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015701	AAC	2	6	4699	4704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015701	ACA	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015701	A	7	7	4752	4758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015701	AGT	2	6	4796	4801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204611
123	NC_015701	A	6	6	4805	4810	100 %	0 %	0 %	0 %	338204611
124	NC_015701	ATCC	2	8	4821	4828	25 %	25 %	0 %	50 %	338204611
125	NC_015701	GAAA	2	8	4872	4879	75 %	0 %	25 %	0 %	338204611
126	NC_015701	A	7	7	4913	4919	100 %	0 %	0 %	0 %	338204611
127	NC_015701	GGAAA	2	10	4921	4930	60 %	0 %	40 %	0 %	338204611
128	NC_015701	CAA	2	6	4937	4942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204611
129	NC_015701	A	6	6	4954	4959	100 %	0 %	0 %	0 %	338204611
130	NC_015701	TCTA	2	8	5061	5068	25 %	50 %	0 %	25 %	338204611
131	NC_015701	CTTA	2	8	5085	5092	25 %	50 %	0 %	25 %	338204611
132	NC_015701	CAT	2	6	5107	5112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204611
133	NC_015701	TAC	2	6	5343	5348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204611
134	NC_015701	ATT	2	6	5374	5379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204611
135	NC_015701	TCA	2	6	5389	5394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204611
136	NC_015701	A	6	6	5421	5426	100 %	0 %	0 %	0 %	338204611
137	NC_015701	GAC	2	6	5428	5433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338204611
138	NC_015701	A	7	7	5525	5531	100 %	0 %	0 %	0 %	338204611
139	NC_015701	ACT	2	6	5556	5561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204611
140	NC_015701	CAAA	2	8	5626	5633	75 %	0 %	0 %	25 %	338204611
141	NC_015701	AACAA	2	10	5641	5650	80 %	0 %	0 %	20 %	338204611
142	NC_015701	TAT	2	6	5663	5668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015701	CAT	3	9	5801	5809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015701	ACA	2	6	5845	5850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015701	ATC	2	6	5869	5874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015701	AATC	2	8	5875	5882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015701	TAA	2	6	5886	5891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015701	ATA	2	6	5910	5915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_015701	ATT	2	6	5958	5963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015701	TAG	2	6	6036	6041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_015701	GTA	2	6	6558	6563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_015701	TAC	2	6	6633	6638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_015701	GTA	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015701	ATT	2	6	6674	6679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_015701	TAC	2	6	6709	6714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_015701	GTA	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_015701	ATC	2	6	11020	11025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204616
283	NC_015701	TAA	2	6	11053	11058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204616
284	NC_015701	CTT	2	6	11239	11244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338204616
285	NC_015701	CTG	2	6	11262	11267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204616
286	NC_015701	ACA	2	6	11322	11327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204616
287	NC_015701	A	6	6	11363	11368	100 %	0 %	0 %	0 %	338204616
288	NC_015701	AT	4	8	11405	11412	50 %	50 %	0 %	0 %	338204616
289	NC_015701	CAA	2	6	11429	11434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204616
290	NC_015701	CGA	2	6	11515	11520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338204616
291	NC_015701	CAC	2	6	11525	11530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338204616
292	NC_015701	GGGA	2	8	11565	11572	25 %	0 %	75 %	0 %	338204616
293	NC_015701	TGA	2	6	11593	11598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204616
294	NC_015701	AAC	2	6	11625	11630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204616
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300	NC_015701	TGA	2	6	12121	12126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204616
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302	NC_015701	A	7	7	12255	12261	100 %	0 %	0 %	0 %	338204616
303	NC_015701	GTG	2	6	12306	12311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338204616
304	NC_015701	AAG	2	6	12341	12346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204616
305	NC_015701	TGA	2	6	12364	12369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204616
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308	NC_015701	AAG	2	6	12530	12535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204616
309	NC_015701	TAA	2	6	12568	12573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204616
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312	NC_015701	ACC	2	6	12707	12712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338204616
313	NC_015701	ACA	2	6	12716	12721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204616
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341	NC_015701	TTA	2	6	14004	14009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
342	NC_015701	AT	3	6	14047	14052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_015701	A	6	6	14053	14058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_015701	CAT	2	6	16908	16913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204620
412	NC_015701	CAT	3	9	16926	16934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204620
413	NC_015701	CCATAT	2	12	16946	16957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204620
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429	NC_015701	TCC	2	6	17782	17787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
430	NC_015701	TTA	2	6	17829	17834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_015701	AAT	2	6	17853	17858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_015701	A	7	7	17891	17897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_015701	ATA	2	6	17905	17910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_015701	TCT	2	6	18008	18013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_015701	ATA	2	6	19038	19043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_015701	AT	4	8	19049	19056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding